ترسیم شبکه تنظیمی مقدماتی

تومان8.500.000

در این دوره سر فصل های زیر آموزش داده می شود:

1- به دست آوردن DEG ها

2- رسم نمودارهای فیلتراسیون و نرمالیزاسیون داده ها

3- نحوه گرفتن اطلاعات پاتولوژیکی بیماران

4- ترسیم ارتباطات بین پروتئینی با برنامه STRING

5- رسم شبکه تنظیمی با نرم افزار Cytoscape

 

Description

شبکه‌های تنظیمی LNC-miR-mRNA شامل سه نوع مولکول هستند:

1. LNC (Long Non-Coding RNA): این مولکول‌ها یک نوع RNA غیرکدکننده هستند که طولانی تر از 200 نوکلئوتید هستند و معمولاً به عنوان کاتالیزور‌های تنظیمی در جهش‌های ژنتیکی، رگولاسیون ترانسکریپت و ترانسلیشن و در توسعه زیستی مشارکت می‌کنند.

2. miR (MicroRNA): این مولکول‌ها نوعی RNA کوتاه کدکننده هستند که طولانی‌ترین آن‌ها شامل 22 نوکلئوتید است. آن‌ها نقش مهمی در پست‌ترانسلیشنال پردازش و تنظیم می‌بازند.

3. mRNA (Messenger RNA): این مولکول‌ها دارای ساختار خطی هستند و کدگذاری برای ساختن پروتئین‌ها را دارند. این شبکه‌ها معمولاً توسط این مولکول‌ها تنظیم می‌شوند.

RStudio یک محیط برنامه‌نویسی و محیطی برای آمار و گرافیک است که بر اساس زبان برنامه‌نویسی R ساخته شده است. این برنامه قدرتمند و چابک برای تحلیل‌های آماری پیچیده و رسم نمودارهاست. به عنوان یک برنامه آماری و گرافیکی، RStudio برای ترسیم شبکه‌های تنظیمی LNC-miR-mRNA بسیار مناسب است. این برنامه مجموعه‌ای از کتابخانه‌ها و ابزارهای گرافیکی برای رسم نمودارهای مختلف را در اختیار کاربران قرار می‌دهد.

برای ترسیم شبکه‌های تنظیمی LNC-miR-mRNA در RStudio، می‌توانید از کتابخانه‌های مختلفی مانند igraph، tidygraph، و Gephi استفاده کنید. این کتابخانه‌ها ابزارهای مختلفی برای ترسیم و تحلیل شبکه‌ها از جمله توابعی برای ایجاد شبکه‌هایی با داده‌های مختلف، تجزیه و تحلیل شبکه‌ها، و رسم نمودارهای مختلف را فراهم می‌کنند.

Additional information

دوره مجازی

Reviews

There are no reviews yet.

Be the first to review “ترسیم شبکه تنظیمی مقدماتی”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *